Data Programming Course  Check-in [6dc63e9d50]

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Comment:corretta la presentazione della prima lezione
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User & Date: EnricoGiampieri 2017-02-28 08:17:21
Context
2017-03-01
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iniziata la preparazione della terza lezione check-in: 18be4e295f user: EnricoGiampieri tags: trunk
2017-02-28
08:17
corretta la presentazione della prima lezione check-in: 6dc63e9d50 user: EnricoGiampieri tags: trunk
2017-02-27
23:59
terminata la prima lezione check-in: 7569babc93 user: EnricoGiampieri tags: trunk
Changes

Changes to Lezione 1 - controllo di versione.html.

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<h2 id="Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">Controllo di versione distribuito e Code Source Management<a class="anchor-link" href="#Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">&#182;</a></h2>
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................................................................................
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<div class="text_cell_render border-box-sizing rendered_html">
<p>Le collaborazioni avvengono tramite un server centrale che fa da punto di scambio.</p>
<p>Potete anche ospitarlo su di un vostro computer, il server è lo stesso programma che avete già scaricato.</p>
<p>Ogni modifica che farete sarà automaticamente registrata sul server in automatico, e passata agli altri quando si collegheranno.</p>













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<p>il concetto dietro questi esempi e questi strumenti è la corretta gestione dei metadata (dati a proposito dei dati).</p>
<p>Considerate un pezzo di programma come quello di prima.
Il nome delle variabili è assolutamente arbitrario, e non influenza in nessun modo il risultato del programma, ma se cambiassi i nomi a caso il codice, seppure corretto, sarebbe incomprensibile, difficile da modificare e in poco tempo dimenticherei completamente il suo scopo d'essere.</p>
<p>Nel codice di solito si usano nomi coerenti e commenti, ma c'è molto altro di cui possiamo tenere traccia se ne siamo consci.</p>

</div>
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<h2 id="Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">Controllo di versione distribuito e Code Source Management<a class="anchor-link" href="#Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">&#182;</a></h2>
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................................................................................
</div>
<div class="inner_cell">
<div class="text_cell_render border-box-sizing rendered_html">
<p>Le collaborazioni avvengono tramite un server centrale che fa da punto di scambio.</p>
<p>Potete anche ospitarlo su di un vostro computer, il server è lo stesso programma che avete già scaricato.</p>
<p>Ogni modifica che farete sarà automaticamente registrata sul server in automatico, e passata agli altri quando si collegheranno.</p>

</div>
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<div class="prompt input_prompt">
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<div class="inner_cell">
<div class="text_cell_render border-box-sizing rendered_html">
<p>cit:</p>

<pre><code>se vale la pena di essere fatto, vale la pena di essere messo sotto controllo di versione</code></pre>

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Changes to Lezione 1 - controllo di versione.ipynb.

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    "* arrivano corredati di molte funzioni e strutture dati di uso comune\n",
    "* rendono molto semplice installare librerie aggiuntive che ne espandono le funzionalità"
   ]
  },
  {
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   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "vediamo un esempio che possa aiutare a capire che cosa intendo, usando il Python"
   ]
  },
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   "execution_count": null,
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    "collapsed": true,


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    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "import os\n",
................................................................................
    "for filename in filenames:\n",
    "    os.rename(filename, filename.replace('.txt', '.csv'))"
   ]
  },
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Vedete che il codice, anche senza commenti, è chiaro e leggibile, ed esprimo dei concetti molto complicati in poche linee di codice"
   ]
  },
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   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Correttezza, ripetibilità (e riproducibilità), auditing\n",
    "\n",
................................................................................
    "    \n",
    "Considerando il numero di progetti che lo scienziato medio deve seguire al giorno d'oggi, lo psicopatico in questione potreste essere voi!"
   ]
  },
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   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "* CORRETTEZZA: essere sicuri che il vostro codice faccia esattamente quello che pensate; qualsiasi modifica facciate, volete essere certi di non aver introdotto errori. Nel caso avvenisse, volete poter tornare indietro.\n",
    "* RIPETIBILITÀ - I: volete essere in grado di ripetere un'analisi ottenendo gli stessi risultati a distanza di tempi anche lunghi. Questo vuol dire tenere traccia di quali siano i requisiti del vostro software, di come si usa, su quali dati e con quali parametri.\n",
    "* RIPETIBILITÀ - II: permettere a qualcun altro di fare lo stesso, possibilmente senza che voi siate li fisicamente presenti a spiegare passo per passo."
   ]
  },
  {
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   "metadata": {


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     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "* RIPRODUCIBILITÀ: permettere ad altri di fare lo stesso, e di testare il vostro codice (ed in generale le vostre idee) sul altri dati ed altri casi rispetto a quelli da voi esaminati.\n",
    "* AUDITING: mantenere la storia del progetto, per sapere cosa è stato fatto, quando e perché. Queste sia per mantenere la comprensione acquisita nel tempo che per permettere a dei revisori esterni di verificare quello che avete fatto."
   ]
  },
  {
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   "metadata": {


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     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Cosa è necessario per avere del codice salubre?\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Durante questo corso cercheremo non solo di insegnarvi la programmazione di alto livello, ma anche come gestire i vostri progetti in modo da limitare il numero di momenti di terrore, disperazione e sconforto che avreste altrimenti."
   ]
  },
  {
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    }
   },
   "source": [
    "Se pensate che stia scherzando, immaginate le seguenti situazioni:\n",
    "\n",
    "* la vostra simulazione ha girato per 36 ore, e fallisce all'ultimo step. Non sapete come recuperare, dovete ripartire da capo, senza essere sicuri di quale sia l'errore"
   ]
  },
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   "metadata": {


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    }
   },
   "source": [
    "* durante l'edit della vostra tesi cancellate un paragrafo (o una intera sezione) e non ve ne accorgete"
   ]
  },
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* vi chiedono di modificare una figura per un articolo, ma il codice per generarla deve far girare di nuovo la famosa simulazione di 36 ore"
   ]
  },
  {
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* dovete dedicarvi agli esami per 6-7 mesi, quando è il momento di riprendere in mano il progetto non ricordate più cosa aveste sperimentato e cosa era ancora nella lista delle cose da fare"
   ]
  },
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     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "* il vostro progamma richiede una serie di step ben precisi per eseguire correttamente. Il gatto vi nasconde il foglietto dove li avete appuntati sotto il divano"
   ]
  },
  {
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   "metadata": {


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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* avete tenuto la documentazione del vostro progetto, ma nell'ultimo backup vi siete dimenticati di copiare l'ultima versione ed ora avete la documentazione ed il codice che non coincidono."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "* fate una modifica al vostro codice, e vi rendete conto durante la presentazione al professore che un passaggio era sbagliato e vi da dei risultati assurdi"
   ]
  },
  {
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   "metadata": {


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    }
   },
   "source": [
    "* prendete in mano il codice di qualcuno, e non avete la più pallida idea del perchè una linea di codice sia lì, ma non potete cambiarla perchè non capite se è essenziale per il codice."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "Questi sono solo alcuni esempi, assolutamente visti capitare nella vita reale, fonti di stress facilmente evitabile.\n",
    "\n",
    "Le procedure che vi insegneremo non possono ovviamente contrastare la sfortuna cieca, ma possono arginarne gli effetti nocivi ed evitare il disastro totale.\n",
    "\n",
    "E sono tutte abbastanza semplici perché usarle non sia uno sforzo immane!"
   ]
  },
















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................................................................................
   "source": [
    "## Controllo di versione distribuito e Code Source Management"
   ]
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    }
   },
   "source": [
    "Avete mai avuto diverse copie di un file, chiamate doc_v1, doc_v2 e così via?\n",
    "\n",
................................................................................
    "Bene, quello è un controllo di versione manuale.\n",
    "Grazie al computer possiamo fare di meglio."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "Possiamo tenere traccia di tutto quello che succede, tornare indietro ad un momento qualsiasi, vedere le differenze fra due versioni successive ed anche tenere \"universi paralleli\" di versioni alternative.\n",
    "\n",
    "I programmi che permettono di farlo sono i Sistemi di Controllo di Versione."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "Questi sono poi affiancati da sistemi di Management del Codice Sorgente, che oltre a tenere traccia della versione permettono anche di tracciare i bug e la documentazione.\n",
    "\n",
    "**Fossil** è una semplice soluzione integrata che vi fornisce tutto questo in un unico pacchetto."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "È già estremamente utile per lavorare da soli, e permette di usare lo stesso strumento per collaborare, coordinando il lavoro di varie persone che lavorano allo stesso progetto, online ed offline."
   ]
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   "metadata": {


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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Le collaborazioni avvengono tramite un server centrale che fa da punto di scambio.\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Ogni modifica che farete sarà automaticamente registrata sul server in automatico, e passata agli altri quando si collegheranno."
   ]
  },
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     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "si può scaricare dal suo sito web: [Fossil-SCM](https://www.fossil-scm.org/xfer/uv/download.html).\n",
    "\n",
    "È un programma free ed open source, cross-platform e contenuto in un unico file, quindi è molto facile da spostare in giro."
   ]
  },
  {
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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Il vostro repository è contenuto in un unico file, un database che contiene tutte le informazioni rilevanti (**new**). \n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Potete estrarne l'ultima versione in una cartella (**open**), modificarla e, quando siete soddisfatti del risultato, inserirla come una versione successiva (**commit**).\n"
   ]
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    }
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   "source": [
    "Potete usare il controllo di versione per qualsiasi file text-based che volete, non soltanto il codice.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
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    "!fossil status"
   ]
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    }
   },
   "source": [
    "a questo punto potete vedere cosa succere lanciando il comando\n",
    "\n",
    "    fossil ui"
   ]
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    }
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    "### timeline\n",
    "\n",
    "![timeline](./immagini/interfaccia_fossil_1.png)"
   ]
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    }
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    "### file list\n",
    "\n",
    "![file list](./immagini/interfaccia_fossil_2.png)"
   ]
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   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Potete creare file di documentazione stile wiki, sempre contenuti nel repository!\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
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................................................................................
   ]
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................................................................................
   ]
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................................................................................
   ]
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    }
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................................................................................
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    "!fossil commit -m \"espansa la documentazione\""
   ]
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    }
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   "source": [
    "### nuova timeline\n",
    "\n",
    "![timeline nuova](./immagini/interfaccia_fossil_3.png)"
   ]
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   "metadata": {


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     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### approfondimenti sull'edit\n",
    "\n",
    "![info edit](./immagini/interfaccia_fossil_4.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "mi sono accorto di aver fatto un errore!\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Per prima cosa, lascio traccia della decisione: apro un ticket."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### preparazione del ticket\n",
    "\n",
    "![ticket preparation](./immagini/interfaccia_fossil_5.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### la lista dei ticket\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 95,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 97,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 98,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 99,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 100,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit -m \"riportato l'ordine nel repository!\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "ora non mi rimane che chiudere il ticket e continuare il mio lavoro"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### branching\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Un grosso vantaggio del modello di DVCS di fossil è che posso usare diverse cartelle per diversi branch, ed avere il tutto sincronizzato!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### un caso tipico di branching\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 102,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil help checkout"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "per comodità faremo il cambio di branch nella stessa directory, ma in generale creeremmo una seconda directory, apriremmo il repository e faremmo il checkout della versione che ci interessa.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 103,
   "metadata": {
    "collapsed": true,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "!fossil checkout e17a3d4a58"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "il repository è vuoto come l'abbiamo lasciato due commit fa."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 104,
   "metadata": {
    "collapsed": true,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "ls"
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 105,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 108,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 109,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 110,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit --allow-fork -m \"nuova storia\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### la nuova timeline\n",
    "\n",
    "![timeline with branch](./immagini/interfaccia_fossil_7.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### aggiusto le proprietà del nuovo branch\n",
    "\n",
    "![timeline with branch](./immagini/interfaccia_fossil_8.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### ecco come appare la mia timeline ora\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "notate che viene registrato anche il cambiamento di nome del branch!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Un'altra operazione molto comune è rinominare o eliminare un file.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 128,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 129,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 130,
   "metadata": {
    "collapsed": true,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "!mv test.txt test2.txt"
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 132,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 149,
   "metadata": {
    "collapsed": true,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "!rm test2.txt"
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 151,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 152,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 153,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 154,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit -m \"ultimo commit del branch sperimentale\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Ora, visto che ci piace renderci la vita complicata, vogliamo unire i due branch.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 155,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 157,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 158,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 159,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 160,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit -m \"le due storie sono finalmente unite!\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### la versione post-sperimentazione\n",
    "\n",
    "![timeline with branch](./immagini/interfaccia_fossil_10.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### full disclosure\n",
    "\n",
................................................................................
    "Il file che abbiamo modificato all'inizio, test.txt, dava problemi per il merge perchè creato indipendentemente nei due branch. L'unica soluzione che ho trovato è stata gestire il merge a mano, in pratica creare un nuovo file da zero ed eventualmente riempirlo con il contenuto del vecchio."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {
    "collapsed": true


   },
   "outputs": [],
   "source": []
  }
 ],
 "metadata": {
  "celltoolbar": "Slideshow",







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    "* arrivano corredati di molte funzioni e strutture dati di uso comune\n",
    "* rendono molto semplice installare librerie aggiuntive che ne espandono le funzionalità"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "vediamo un esempio che possa aiutare a capire che cosa intendo, usando il Python"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "import os\n",
................................................................................
    "for filename in filenames:\n",
    "    os.rename(filename, filename.replace('.txt', '.csv'))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Vedete che il codice, anche senza commenti, è chiaro e leggibile, ed esprimo dei concetti molto complicati in poche linee di codice"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Correttezza, ripetibilità (e riproducibilità), auditing\n",
    "\n",
................................................................................
    "    \n",
    "Considerando il numero di progetti che lo scienziato medio deve seguire al giorno d'oggi, lo psicopatico in questione potreste essere voi!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "* CORRETTEZZA: essere sicuri che il vostro codice faccia esattamente quello che pensate; qualsiasi modifica facciate, volete essere certi di non aver introdotto errori. Nel caso avvenisse, volete poter tornare indietro.\n",
    "* RIPETIBILITÀ - I: volete essere in grado di ripetere un'analisi ottenendo gli stessi risultati a distanza di tempi anche lunghi. Questo vuol dire tenere traccia di quali siano i requisiti del vostro software, di come si usa, su quali dati e con quali parametri.\n",
    "* RIPETIBILITÀ - II: permettere a qualcun altro di fare lo stesso, possibilmente senza che voi siate li fisicamente presenti a spiegare passo per passo."
   ]
  },
  {
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    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "* RIPRODUCIBILITÀ: permettere ad altri di fare lo stesso, e di testare il vostro codice (ed in generale le vostre idee) sul altri dati ed altri casi rispetto a quelli da voi esaminati.\n",
    "* AUDITING: mantenere la storia del progetto, per sapere cosa è stato fatto, quando e perché. Queste sia per mantenere la comprensione acquisita nel tempo che per permettere a dei revisori esterni di verificare quello che avete fatto."
   ]
  },
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    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Cosa è necessario per avere del codice salubre?\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Durante questo corso cercheremo non solo di insegnarvi la programmazione di alto livello, ma anche come gestire i vostri progetti in modo da limitare il numero di momenti di terrore, disperazione e sconforto che avreste altrimenti."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "Se pensate che stia scherzando, immaginate le seguenti situazioni:\n",
    "\n",
    "* la vostra simulazione ha girato per 36 ore, e fallisce all'ultimo step. Non sapete come recuperare, dovete ripartire da capo, senza essere sicuri di quale sia l'errore"
   ]
  },
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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* durante l'edit della vostra tesi cancellate un paragrafo (o una intera sezione) e non ve ne accorgete"
   ]
  },
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   "metadata": {
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    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* vi chiedono di modificare una figura per un articolo, ma il codice per generarla deve far girare di nuovo la famosa simulazione di 36 ore"
   ]
  },
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* dovete dedicarvi agli esami per 6-7 mesi, quando è il momento di riprendere in mano il progetto non ricordate più cosa aveste sperimentato e cosa era ancora nella lista delle cose da fare"
   ]
  },
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    "slideshow": {
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    }
   },
   "source": [
    "* il vostro progamma richiede una serie di step ben precisi per eseguire correttamente. Il gatto vi nasconde il foglietto dove li avete appuntati sotto il divano"
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "* avete tenuto la documentazione del vostro progetto, ma nell'ultimo backup vi siete dimenticati di copiare l'ultima versione ed ora avete la documentazione ed il codice che non coincidono."
   ]
  },
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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* fate una modifica al vostro codice, e vi rendete conto durante la presentazione al professore che un passaggio era sbagliato e vi da dei risultati assurdi"
   ]
  },
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "* prendete in mano il codice di qualcuno, e non avete la più pallida idea del perchè una linea di codice sia lì, ma non potete cambiarla perchè non capite se è essenziale per il codice."
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "Questi sono solo alcuni esempi, assolutamente visti capitare nella vita reale, fonti di stress facilmente evitabile.\n",
    "\n",
    "Le procedure che vi insegneremo non possono ovviamente contrastare la sfortuna cieca, ma possono arginarne gli effetti nocivi ed evitare il disastro totale.\n",
    "\n",
    "E sono tutte abbastanza semplici perché usarle non sia uno sforzo immane!"
   ]
  },
  {
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   "metadata": {
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "il concetto dietro questi esempi e questi strumenti è la corretta gestione dei metadata (dati a proposito dei dati).\n",
    "\n",
    "Considerate un pezzo di programma come quello di prima.\n",
    "Il nome delle variabili è assolutamente arbitrario, e non influenza in nessun modo il risultato del programma, ma se cambiassi i nomi a caso il codice, seppure corretto, sarebbe incomprensibile, difficile da modificare e in poco tempo dimenticherei completamente il suo scopo d'essere.\n",
    "\n",
    "Nel codice di solito si usano nomi coerenti e commenti, ma c'è molto altro di cui possiamo tenere traccia se ne siamo consci."
   ]
  },
  {
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   "metadata": {
    "collapsed": true,
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    "slideshow": {
................................................................................
   "source": [
    "## Controllo di versione distribuito e Code Source Management"
   ]
  },
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    }
   },
   "source": [
    "Avete mai avuto diverse copie di un file, chiamate doc_v1, doc_v2 e così via?\n",
    "\n",
................................................................................
    "Bene, quello è un controllo di versione manuale.\n",
    "Grazie al computer possiamo fare di meglio."
   ]
  },
  {
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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Possiamo tenere traccia di tutto quello che succede, tornare indietro ad un momento qualsiasi, vedere le differenze fra due versioni successive ed anche tenere \"universi paralleli\" di versioni alternative.\n",
    "\n",
    "I programmi che permettono di farlo sono i Sistemi di Controllo di Versione."
   ]
  },
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     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Questi sono poi affiancati da sistemi di Management del Codice Sorgente, che oltre a tenere traccia della versione permettono anche di tracciare i bug e la documentazione.\n",
    "\n",
    "**Fossil** è una semplice soluzione integrata che vi fornisce tutto questo in un unico pacchetto."
   ]
  },
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    }
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   "source": [
    "È già estremamente utile per lavorare da soli, e permette di usare lo stesso strumento per collaborare, coordinando il lavoro di varie persone che lavorano allo stesso progetto, online ed offline."
   ]
  },
  {
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Le collaborazioni avvengono tramite un server centrale che fa da punto di scambio.\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Ogni modifica che farete sarà automaticamente registrata sul server in automatico, e passata agli altri quando si collegheranno."
   ]
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   "metadata": {
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "cit:\n",
    "\n",
    "    se vale la pena di essere fatto, vale la pena di essere messo sotto controllo di versione"
   ]
  },
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    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "si può scaricare dal suo sito web: [Fossil-SCM](https://www.fossil-scm.org/xfer/uv/download.html).\n",
    "\n",
    "È un programma free ed open source, cross-platform e contenuto in un unico file, quindi è molto facile da spostare in giro."
   ]
  },
  {
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   "metadata": {
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    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Il vostro repository è contenuto in un unico file, un database che contiene tutte le informazioni rilevanti (**new**). \n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Potete estrarne l'ultima versione in una cartella (**open**), modificarla e, quando siete soddisfatti del risultato, inserirla come una versione successiva (**commit**).\n"
   ]
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   "source": [
    "Potete usare il controllo di versione per qualsiasi file text-based che volete, non soltanto il codice.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
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................................................................................
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................................................................................
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................................................................................
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    "!fossil status"
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   "source": [
    "a questo punto potete vedere cosa succere lanciando il comando\n",
    "\n",
    "    fossil ui"
   ]
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    "### timeline\n",
    "\n",
    "![timeline](./immagini/interfaccia_fossil_1.png)"
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   "source": [
    "### file list\n",
    "\n",
    "![file list](./immagini/interfaccia_fossil_2.png)"
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   "source": [
    "Potete creare file di documentazione stile wiki, sempre contenuti nel repository!\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
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     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
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................................................................................
   ]
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     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
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  {
   "cell_type": "code",
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     "slide_type": "fragment"
    }
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     "name": "stdout",
................................................................................
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    "!fossil commit -m \"espansa la documentazione\""
   ]
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    "### nuova timeline\n",
    "\n",
    "![timeline nuova](./immagini/interfaccia_fossil_3.png)"
   ]
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    "### approfondimenti sull'edit\n",
    "\n",
    "![info edit](./immagini/interfaccia_fossil_4.png)"
   ]
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   "source": [
    "mi sono accorto di aver fatto un errore!\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Per prima cosa, lascio traccia della decisione: apro un ticket."
   ]
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    "### preparazione del ticket\n",
    "\n",
    "![ticket preparation](./immagini/interfaccia_fossil_5.png)"
   ]
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    "### la lista dei ticket\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
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................................................................................
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................................................................................
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................................................................................
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................................................................................
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................................................................................
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    "!fossil commit -m \"riportato l'ordine nel repository!\""
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    "ora non mi rimane che chiudere il ticket e continuare il mio lavoro"
   ]
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   "source": [
    "### branching\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "Un grosso vantaggio del modello di DVCS di fossil è che posso usare diverse cartelle per diversi branch, ed avere il tutto sincronizzato!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### un caso tipico di branching\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 102,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil help checkout"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "per comodità faremo il cambio di branch nella stessa directory, ma in generale creeremmo una seconda directory, apriremmo il repository e faremmo il checkout della versione che ci interessa.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 103,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "!fossil checkout e17a3d4a58"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "il repository è vuoto come l'abbiamo lasciato due commit fa."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 104,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "ls"
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 105,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 108,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 109,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 110,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit --allow-fork -m \"nuova storia\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### la nuova timeline\n",
    "\n",
    "![timeline with branch](./immagini/interfaccia_fossil_7.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### aggiusto le proprietà del nuovo branch\n",
    "\n",
    "![timeline with branch](./immagini/interfaccia_fossil_8.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### ecco come appare la mia timeline ora\n",
    "\n",
................................................................................
    "\n",
    "notate che viene registrato anche il cambiamento di nome del branch!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Un'altra operazione molto comune è rinominare o eliminare un file.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 128,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 129,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 130,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "!mv test.txt test2.txt"
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 132,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 149,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "!rm test2.txt"
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 151,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 152,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 153,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 154,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit -m \"ultimo commit del branch sperimentale\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Ora, visto che ci piace renderci la vita complicata, vogliamo unire i due branch.\n",
    "\n",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 155,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 157,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 158,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 159,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 160,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
................................................................................
   "source": [
    "!fossil commit -m \"le due storie sono finalmente unite!\""
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### la versione post-sperimentazione\n",
    "\n",
    "![timeline with branch](./immagini/interfaccia_fossil_10.png)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "### full disclosure\n",
    "\n",
................................................................................
    "Il file che abbiamo modificato all'inizio, test.txt, dava problemi per il merge perchè creato indipendentemente nei due branch. L'unica soluzione che ho trovato è stata gestire il merge a mano, in pratica creare un nuovo file da zero ed eventualmente riempirlo con il contenuto del vecchio."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": null,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true
   },
   "outputs": [],
   "source": []
  }
 ],
 "metadata": {
  "celltoolbar": "Slideshow",

Changes to Lezione 1 - controllo di versione.slides.html.

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<h2 id="Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">Controllo di versione distribuito e Code Source Management<a class="anchor-link" href="#Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">&#182;</a></h2>
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<p>Le collaborazioni avvengono tramite un server centrale che fa da punto di scambio.</p>
<p>Potete anche ospitarlo su di un vostro computer, il server è lo stesso programma che avete già scaricato.</p>
<p>Ogni modifica che farete sarà automaticamente registrata sul server in automatico, e passata agli altri quando si collegheranno.</p>













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<div class="text_cell_render border-box-sizing rendered_html">
<p>il concetto dietro questi esempi e questi strumenti è la corretta gestione dei metadata (dati a proposito dei dati).</p>
<p>Considerate un pezzo di programma come quello di prima.
Il nome delle variabili è assolutamente arbitrario, e non influenza in nessun modo il risultato del programma, ma se cambiassi i nomi a caso il codice, seppure corretto, sarebbe incomprensibile, difficile da modificare e in poco tempo dimenticherei completamente il suo scopo d'essere.</p>
<p>Nel codice di solito si usano nomi coerenti e commenti, ma c'è molto altro di cui possiamo tenere traccia se ne siamo consci.</p>

</div>
</div>
</div></section></section><section><section>
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<h2 id="Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">Controllo di versione distribuito e Code Source Management<a class="anchor-link" href="#Controllo-di-versione-distribuito-e-Code-Source-Management">&#182;</a></h2>
</div>
</div>
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................................................................................
</div>
<div class="inner_cell">
<div class="text_cell_render border-box-sizing rendered_html">
<p>Le collaborazioni avvengono tramite un server centrale che fa da punto di scambio.</p>
<p>Potete anche ospitarlo su di un vostro computer, il server è lo stesso programma che avete già scaricato.</p>
<p>Ogni modifica che farete sarà automaticamente registrata sul server in automatico, e passata agli altri quando si collegheranno.</p>

</div>
</div>
</div></div><div class="fragment">
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</div>
<div class="inner_cell">
<div class="text_cell_render border-box-sizing rendered_html">
<p>cit:</p>

<pre><code>se vale la pena di essere fatto, vale la pena di essere messo sotto controllo di versione</code></pre>

</div>
</div>
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