Data Programming Course  Check-in [0c54dd1e72]

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User & Date: EnricoGiampieri 2017-02-27 08:50:20.866
Context
2017-02-27
08:50
aggiunto uno snakefile per la compilazione automatica dei notebook in html check-in: adcc1efba3 user: EnricoGiampieri tags: trunk
08:50
added a local reference for the images check-in: 0c54dd1e72 user: EnricoGiampieri tags: trunk
08:09
aggiunta la cartella con le immagini per i notebook check-in: be2a2968d0 user: EnricoGiampieri tags: trunk
Changes
Unified Diff Ignore Whitespace Patch
Changes to Lezione 2b - Iteratori e Big Data.ipynb.
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    "Normalmente si può trovare come definizione di big data la seguente:\n",
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    "    \n",
    "Esiste però un altro problema Big:\n",
    "\n",
    "    anche su dati piccoli, il mio modello potrebbe richiedere più\n",
    "    risorse di quelle a mia disposizione"
   ]
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    "\n",
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    "\n",
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    "* lo spazio su RAM che siamo disponibili ad allocare\n",
    "* l'ammontare di informazioni che vogliamo ottenere (statistical power)\n",
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    "Tanto più ottimizziamo uno di questi parametri, tanto più ci rimettiamo negli altri due."
   ]
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    "    \n",
    "Esiste però un altro problema Big:\n",
    "\n",
    "    anche su dati piccoli, il mio modello potrebbe richiedere più\n",
    "    risorse di quelle a mia disposizione"
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    "\n",
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    "* lo spazio su RAM che siamo disponibili ad allocare\n",
    "* l'ammontare di informazioni che vogliamo ottenere (statistical power)\n",
    "\n",
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    "        new_filename = filename.lower()\n",
    "        os.rename(os.path.join(basepath, filename),\n",
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    "qui però sto anche cambiando il nome a tutti i file che sono presenti nelle directory, anche se non sono dei file audio!"
   ]
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    "for basepath, listdir, listfiles in os.walk(directory):\n",
    "    for filename in listfiles:\n",
    "        if filename.lower().endswith('mp3'):\n",
    "            new_filename = filename.lower()\n",
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   "cell_type": "code",
   "execution_count": 37,
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [],
   "source": [
    "directory = \"./notebookfiles/fakeaudio/\"\n",
    "for basepath, listdir, listfiles in os.walk(directory):\n",
    "    for filename in listfiles:\n",
    "        if filename.lower().endswith('mp3'):\n",
    "            new_filename = filename.lower()\n",
    "            os.rename(os.path.join(basepath, filename),\n",
    "                      os.path.join(basepath, new_filename))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 38,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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    "!ls -lR notebookfiles/fakeaudio/"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Queste sono tre operazioni fondalmentali per l'analisi dati:\n",
    "\n",
    "* iterazione lazy\n",
    "* map (ripeti un'operazione su tutti gli elementi)\n",
    "* filter (seleziona solo una parte degli elementi)\n",
    "\n",
    "altri tipi di operazioni che discuteremo saranno:\n",
    "\n",
    "* reduce (comporre insieme gli elementi)\n",
    "* functional programming\n"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Iterazione Lazy\n",
    "\n",
    "che cosa intendiamo con iterazione **lazy**?\n",
    "\n",
    "le operazioni non vengono compiute finchè il risultato non è richiesto!!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "In Python questa cosa è gestita da degli oggetti chiamati **iteratori**.\n",
    "\n",
    "Sono gli oggetti su cui faccio i cicli **for**.\n",
    "\n",
    "Un iteratore può essere percorso una volta sola!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "Questo è controintuitivo: se provo a fare un ciclo for su di una lista, lo posso fare quante volte voglio"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 39,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
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    {
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   ]
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    "editable": true,
    "slideshow": {
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    }
   },
   "source": [
    "Queste sono tre operazioni fondalmentali per l'analisi dati:\n",
    "\n",
    "* iterazione lazy\n",
    "* map (ripeti un'operazione su tutti gli elementi)\n",
    "* filter (seleziona solo una parte degli elementi)\n",
    "\n",
    "altri tipi di operazioni che discuteremo saranno:\n",
    "\n",
    "* reduce (comporre insieme gli elementi)\n",
    "* functional programming\n"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Iterazione Lazy\n",
    "\n",
    "che cosa intendiamo con iterazione **lazy**?\n",
    "\n",
    "le operazioni non vengono compiute finchè il risultato non è richiesto!!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
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     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "In Python questa cosa è gestita da degli oggetti chiamati **iteratori**.\n",
    "\n",
    "Sono gli oggetti su cui faccio i cicli **for**.\n",
    "\n",
    "Un iteratore può essere percorso una volta sola!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
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    }
   },
   "source": [
    "Questo è controintuitivo: se provo a fare un ciclo for su di una lista, lo posso fare quante volte voglio"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 39,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
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   "metadata": {


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    }
   },
   "source": [
    "ma se provo a farlo su di un file, lo posso leggere una volta sola!\n",
    "\n",
    "Se volessi rileggerlo, dovrei aprirlo di nuovo!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 40,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
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    "for elemento in lista:\n",
    "    print(elemento)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "ma se provo a farlo su di un file, lo posso leggere una volta sola!\n",
    "\n",
    "Se volessi rileggerlo, dovrei aprirlo di nuovo!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 40,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
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    }
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    "    for line in file:\n",
    "        print(repr(line))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Python ce lo nasconde, ma in realtà ogni volta che iteriamo sulla lista lui crea un nuovo iteratore che scorre la lista e poi scompare.\n",
    "\n",
    "Possiamo farlo esplicitamente con il comando **iter**"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 42,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
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    "    for line in file:\n",
    "        print(repr(line))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Python ce lo nasconde, ma in realtà ogni volta che iteriamo sulla lista lui crea un nuovo iteratore che scorre la lista e poi scompare.\n",
    "\n",
    "Possiamo farlo esplicitamente con il comando **iter**"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 42,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "collapsed": true,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Sottolineare quando le iterazioni non necessitano di caricare l'intero dataset è importante perchè non è sempre vero.\n",
    "\n",
    "Supponiamo di voler calcolare tutte le combinazioni di elementi di una sequenza: non possiamo risolvere questo problema senza tenere in memoria l'intera sequenza!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "collapsed": true,


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Map\n",
    "\n",
    "Un tipo di operazione molto frequente sulle sequenze è il cosiddetto **mapping**, ovvero applicare una funzione a tutti gli elementi di una lista, uno alla volta ed indipendentemente dagli altri.\n",
    "\n",
    "Ad esempio, avendo una serie di numeri, potrei voler prendere il quadrato di ciascuno."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 46,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
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    "    print(elemento)"
   ]
  },
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   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Sottolineare quando le iterazioni non necessitano di caricare l'intero dataset è importante perchè non è sempre vero.\n",
    "\n",
    "Supponiamo di voler calcolare tutte le combinazioni di elementi di una sequenza: non possiamo risolvere questo problema senza tenere in memoria l'intera sequenza!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "collapsed": true,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Map\n",
    "\n",
    "Un tipo di operazione molto frequente sulle sequenze è il cosiddetto **mapping**, ovvero applicare una funzione a tutti gli elementi di una lista, uno alla volta ed indipendentemente dagli altri.\n",
    "\n",
    "Ad esempio, avendo una serie di numeri, potrei voler prendere il quadrato di ciascuno."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 46,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
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    "    \n",
    "print(quadrati)"
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  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Questo può essere espresso in modo pi conciso con una *comprehension*, che è funzionalmente identica al ciclo visto prima, ma più sintetica"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 51,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
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    "    \n",
    "print(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Questo può essere espresso in modo pi conciso con una *comprehension*, che è funzionalmente identica al ciclo visto prima, ma più sintetica"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 51,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
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693
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    "quadrati = [x**2 for x in numeri]\n",
    "print(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "il concetto di **map** è un'astrazione di questo procedimento.\n",
    "\n",
    "Python fornisce una funzione, chiamata appunto **map**, che prende una funzione ed un iteratore e ritorna un iteratore i cui elementi sono il risultato dell'operazione"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 53,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
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    "quadrati = [x**2 for x in numeri]\n",
    "print(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "il concetto di **map** è un'astrazione di questo procedimento.\n",
    "\n",
    "Python fornisce una funzione, chiamata appunto **map**, che prende una funzione ed un iteratore e ritorna un iteratore i cui elementi sono il risultato dell'operazione"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 53,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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759
760
761
    "quadrati = map(quadrato, numeri)\n",
    "print(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "ricordiamoci che il risultato delle operazioni sugli iteratori, quando possibile, è a sua volta un iteratore!\n",
    "\n",
    "siamo noi che dobbiamo esplicitamente **concretizzare** l'iterazione"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 54,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "data": {







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    "quadrati = map(quadrato, numeri)\n",
    "print(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "source": [
    "ricordiamoci che il risultato delle operazioni sugli iteratori, quando possibile, è a sua volta un iteratore!\n",
    "\n",
    "siamo noi che dobbiamo esplicitamente **concretizzare** l'iterazione"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 54,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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796
797
   "source": [
    "list(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "ricordiamoci che l'iterazione è compiuta una volta sola, quindi se vogliamo il risultato dobbiamo salvarcelo alla prima concretizzazione!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 55,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
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    {
     "data": {







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867
868
869
   "source": [
    "list(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "ricordiamoci che l'iterazione è compiuta una volta sola, quindi se vogliamo il risultato dobbiamo salvarcelo alla prima concretizzazione!"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 55,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
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835
   "source": [
    "list(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Filter\n",
    "\n",
    "in modo simile il concetto di **filter** è piuttosto semplice: seleziono un sottoinsieme dei miei dati, generando un secondo iteratore."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 56,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
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   },
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910
911
   "source": [
    "list(quadrati)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Filter\n",
    "\n",
    "in modo simile il concetto di **filter** è piuttosto semplice: seleziono un sottoinsieme dei miei dati, generando un secondo iteratore."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 56,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
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    {
     "name": "stdout",
848
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868
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872
873
874
    "\n",
    "print(positivi)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "in modo simile all'operazione di **map**, anche l'operazione di **filter** ha un costrutto nel linguaggio tramite le *comprehension*"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 57,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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950
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952
953
954
    "\n",
    "print(positivi)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "in modo simile all'operazione di **map**, anche l'operazione di **filter** ha un costrutto nel linguaggio tramite le *comprehension*"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 57,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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883
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    "positivi = [x for x in numeri if x>0]\n",
    "print(positivi)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "ed esattamente come prima, abbiamo una funzione che prende una funzione di filtro (che ci dice se l'elemento è accettabile o no) e la applica ad un operatore"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 60,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
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991
992
993
    "positivi = [x for x in numeri if x>0]\n",
    "print(positivi)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "ed esattamente come prima, abbiamo una funzione che prende una funzione di filtro (che ci dice se l'elemento è accettabile o no) e la applica ad un operatore"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 60,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
920
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943
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945
946
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948
    "positivi = filter(is_positive, numeri)\n",
    "print(list(positivi))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Reduce\n",
    "\n",
    "questa operazione combina gli elementi di un iteratore in un elemento unico"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 61,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",







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1035
1036
    "positivi = filter(is_positive, numeri)\n",
    "print(list(positivi))"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "## Reduce\n",
    "\n",
    "questa operazione combina gli elementi di un iteratore in un elemento unico"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 61,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
960
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983
984
985
986
    "    \n",
    "print(totale)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "come per casi precedenti, esiste una funzione preesistente per effettuare le operazioni di riduzione"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 64,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",







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1075
1076
1077
1078
    "    \n",
    "print(totale)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "come per casi precedenti, esiste una funzione preesistente per effettuare le operazioni di riduzione"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 64,
   "metadata": {
    "collapsed": false,
    "deletable": true,
    "editable": true,
    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
1000
1001
1002
1003
1004
1005
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1039
1040
1041
1042
    "totale = reduce(somma, numeri, 0)\n",
    "print(totale)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "Questo tipo di operazioni è così comune che ci sono una serie di operazioni predefinite:\n",
    "\n",
    "* **sum** per la somma\n",
    "* **min** e **max** per il minimo e massimo\n",
    "\n",
    "e così via"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "markdown",
   "metadata": {


    "slideshow": {
     "slide_type": "slide"
    }
   },
   "source": [
    "una tipica riduzione, che useremo molto, è la stima delle frequenze."
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 71,
   "metadata": {
    "collapsed": false,


    "slideshow": {
     "slide_type": "fragment"
    }
   },
   "outputs": [
    {
     "data": {







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1135
1136
1137
1138
1139
1140
    "totale = reduce(somma, numeri, 0)\n",
    "print(totale)"
   ]
  },
  {
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    "Questo tipo di operazioni è così comune che ci sono una serie di operazioni predefinite:\n",
    "\n",
    "* **sum** per la somma\n",
    "* **min** e **max** per il minimo e massimo\n",
    "\n",
    "e così via"
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    "una tipica riduzione, che useremo molto, è la stima delle frequenze."
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    "Una proprietà importante delle riduzioni è che i risultati si possono combinare: dati i conteggi su due serie, posso sommare insieme i due conteggi ed ottenere i conteggi totali fra le due serie"
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    "\n",
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    "* invio le sequenze a diversi computer\n",
    "* compio una riduzione su ciascuna sottosequenza\n",
    "* raccolgo le sottosequenze e le combino insieme\n",
    "* tutto questo fatto in modo ricorsivo"
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